Logo kỷ niệm 65 năm cơ bản có 3 màu sắc: xanh, đỏ, trắng, được thiết kế điểm nhấn là số 65, quyển sách cách điệu và dòng chữ VNU – HUS với các chi tiết mang ý nghĩa như sau:
- Dòng chữ số 1956 – 2021 màu xanh (màu cụm logo) bên trên số 5: thể hiện mốc thời gian thành lập Trường (1956) đến nay.
- Số 65 màu xanh (màu cụm logo): thể hiện chặng đường 65 năm xây dựng và phát triển của Trường Đại học Khoa học Tự nhiên từ tiền thân là Trường Đại học Tổng hợp Hà Nội.
- Mẫu hành tinh nguyên tử màu trắng (nằm trong phiên bản cách điệu cụm logo của Trường): thể hiện công tác đào tạo, nghiên cứu của Trường trong các lĩnh vực khoa học tự nhiên.
- Quyển sách mở màu đỏ: được cách điệu nâng đỡ số 65 thể hiện sự đóng góp của Trường trong công tác đào tạo, nghiên cứu khoa học từ ngày đầu thành lập đến nay. Quyển sách gồm 2 lớp ẩn dụ lịch sử thành lập và phát triển của Nhà trường qua 2 thời kỳ: Trường Đại học Tổng hợp Hà Nội trước đây và Trường Đại học Khoa học Tự nhiên ngày nay. Những trang sách mở cũng cho thấy sự rộng mở của chân trời tri thức, nâng cánh cho những ước mơ, hoài bão vươn tới tầm cao của khoa học. Ở một góc nhìn khác, những dải màu đỏ trông giống như những cánh chim đang tung bay, tượng trưng cho hình ảnh các thế hệ sinh viên, với đầy đủ hành trang tri thức đã được các thày cô giáo trang bị cho khi còn ngồi trên ghế nhà trường, sẽ trưởng thành sải cánh bay đi muôn phương đóng góp cho khoa học và sự phát triển của Đất nước.
- Dòng chữ: VNU – HUS màu xanh: thể hiện tên viết tắt tiếng Anh nhận diện của Trường Đại học Khoa học Tự nhiên, Đại học Quốc gia Hà Nội.
Lễ kỷ niệm 65 năm truyền thống Trường Đại học Tổng hợp Hà Nội, tiền thân của Trường Đại học Khoa học Tự nhiên – Đại học Quốc gia Hà Nội, dự kiến sẽ được tổ chức vào ngày 6/11/2021. Trước đó, phiên toàn thể Hội nghị Khoa học Trường Đại học Khoa học Tự nhiên với chủ đề “Đổi mới sáng tạo gắn với Nghiên cứu cơ bản ở Trường Đại học Khoa học Tự nhiên” sẽ được tổ chức vào ngày 4/11/2021.
